遗传图谱构建和QTL定位
遗(yi)传(chuan)图(tu)谱(pu)也叫连(lian)锁遗(yi)传(chuan)图(tu)谱(pu)(Genetic linkage map),是(shi)以基(ji)因(yin)(yin)或者(zhe)遗(yi)传(chuan)标记之(zhi)间的(de)连(lian)锁和重(zhong)组交换值(zhi)构(gou)建的(de)图(tu)谱(pu)。QTL 定位(wei)是(shi)通过对(dui)遗(yi)传(chuan)标记与(yu)性状之(zhi)间相(xiang)关性的(de)分析,将(jiang)一个或多(duo)个QTL 定位(wei)到(dao)染色体的(de)遗(yi)传(chuan)标记之(zhi)间。 赢(ying)博电(dian)竞(jing)森提供基(ji)于基(ji)因(yin)(yin)芯片和高通量测序(xu)的(de)高密度遗(yi)传(chuan)图(tu)谱(pu)构(gou)建及QTL 定位(wei)服务,助力(li)重(zhong)要(yao)育(yu)种(zhong)价值(zhi)基(ji)因(yin)(yin)的(de)挖掘。
Sample requirements
材料准备
首先需(xu)要(yao)构建作(zuo)图(tu)群体(ti)(ti)(ti)进(jin)行(xing)(xing)高质量(liang)遗传(chuan)连锁(suo)(suo)图(tu)的(de)绘制,然(ran)后(hou)(hou)测定(ding)(ding)作(zuo)图(tu)群体(ti)(ti)(ti)中不(bu)同个体(ti)(ti)(ti)或(huo)株系的(de)标记基(ji)因型;对标记基(ji)因型数据进(jin)行(xing)(xing)连锁(suo)(suo)分析,构建标记连锁(suo)(suo)图(tu)。然(ran)后(hou)(hou)将QTL定(ding)(ding)位在遗传(chuan)图(tu)谱(pu)上,确定(ding)(ding)QTL与(yu)遗传(chuan)标记间的(de)距离(li)(以重组(zu)率(lv)表示)。
作图群体
临时作图群体:F1、F2、BC等永久作图群体:RIL、NIL、DH等分子标记
SSRSNP模型选择
区间作图法 IM复合区间作图法 CIM多重区间作图法 MIM
Schematic diagram
技术示意图
结果展示
文章(zhang)使用Affymetrix 小麦 660K SNP 芯片对六(liu) 倍体小麦进(jin)行(xing)检测。由此得到全长4424.4 cM 包(bao)含 11566 个(ge)(ge)标记的高密度遗传图谱(pu),其中119001 个(ge)(ge)位 点为SNP 标记。
◎ Cui, F. , Zhang, N. , Fan, X. L. , Zhang, W. , Zhao, C. H. , & Yang, L. J. , et al. (2017). Utilization of a wheat660k snp array-derived high-density genetic map for highresolution mapping of a major qtl for kernel number. Scientific Reports, 7(1), 3788.